Streams and Life 河流生態與生物 www.epa.url.tw 林雨莊編集
第十三章 河流魚類
魚類是河流裡的重要生物，以下我們探討幾個主題：魚的解學結構，它們的攝食作用，棲息地和行為，並以開發生物評估工具為基礎，在一個地點發現的魚類集合的多樣性。研究台灣溪流中的幾個主要魚科。
13.1 魚類的生物特徵
我們觀察魚的外部特徵，可以分類其功能。漫遊捕食者是流線型的，四處遊蕩尋找獵物。潛伏水底的捕食者(鲶魚)有著像魚雷形狀的長矛，能夠從埋伏中突然爆發出速度。表面導向的魚有向上的嘴和大眼睛，通常是從水面捕獲獵物的小物種。底棲魚類通常是扁平的，在急流岩塊上的禿頭鯊、鰕虎魚需要流線三角形的背部及扁平吸盤的腹部，免得被水流沖走。身體高的鯉魚、鯽魚通常是左右扁平，有刺以抵禦敵人，通常有大胸鰭。鰻魚身體細長滑溜，背鰭和臀鰭特別長，可以在裂縫和洞穴中進出。
簡要介紹一些額外的內部和外部解剖學方面，將有助於我們瞭解魚類。魚類身體兩側的側線感測，提供了探測獵物和障礙物的能力。在魚體內部，許多魚類有魚膘(游泳膀胱)可以在三維空間中輕鬆地升降移動。底棲魚類通常減少了游泳囊，或者完全失去了這種適應能力。魚類利用鰓來提取氧氣呼吸，但是它們的活動和代謝需求、對低氧的耐受能力以及通過吸入空氣補充水資源的能力有很大的不同。魚類對通過水傳播的聲音很敏感，大多數魚類有類似耳骨的連接使它們能聽到聲音，並在交配過程中進行交流。
與空氣相比，水對光的傳播很差。即使是最大的物體，在水裡的距離大於40米的地方就不容易被看到。水對光也有過濾作用，光譜的藍端比紅端先被吸收。因此，水中光的光譜特性取決於深度和水質。在許多淡水和河口水域，溶解和懸浮物質的含量最高，通常呈現黃色或綠色。許多魚類的眼睛都發育良好。許多硬骨魚的視覺色素表明它們有色覺。
13.2 魚類的多樣性
魚類占脊椎動物物種的50%以上，在已識別的兩萬多種魚類中， 96%是硬骨魚類，淡水域沒有鯊魚、魟魚，幾乎都是硬骨魚類。雖然淡水只占地球表面積的1%，占地球總水量的不到0.01%，但約有40%的魚類生活在淡水中。
典型的魚類具有放熱性(冷血的)，具有流線型的身體可以快速游泳，可以使用鰓從水中提取氧氣，也可以使用附屬的呼吸器官來呼吸大氣中的氧氣，有兩組成對的鰭，通常是一到兩個背鰭，肛門鰭和尾鰭有下巴，皮膚通常被鱗片覆蓋，並產卵。淡水魚使用各種不同的結構從空氣以及水中提取氧氣。許多鯰魚經由腸或胃提取氧。身體形狀和翅片的佈置是高度可變的。
由於河流環境多樣，水深、流速、河幅空間、食物來源、河床基質、日照、溶氧、水溫、鹽度、懸浮濁度等各有不同，淡水魚類也因此特異化發展，有了不同的棲息位(niche)，上游、中游、下游、河口、支流、主流、河心、淺水邊、湍瀨、深潭、水上層、水底層、中間層，棲息的魚類都有不同。
台灣約有 220 種淡水魚(含河口魚類)，其中約有 30 多種為台灣特有種，標注符號(*)。其中經行政院農委會公告的瀕臨絕種保育類有高身鏟頜魚和台灣鮭魚 2種，珍貴稀有保育類有台東間爬岩鰍、埔里中華爬岩鰍、台灣鬥魚和鱸鰻等 4種。也有許多外來種，標注符號(&)。
台灣溪流上游冷水常見魚類有：
鯉科：台灣鏟頜魚(鯝魚)、高身鏟頜魚(高身鯝魚)*、台灣纓口鰍*。鮭科：台灣鉤吻鮭、虹鱒&。鰍科：台灣馬口魚*、。
台灣鏟頜魚體延長而略圓，頭胸呈圓 筒形，體後半部側扁，頭寬圓而稍尖，吻 短、圓鈍而突出，成魚吻端具有多個堅硬 的追星。 眼中大，位於頭側的上方，眼間 寬而稍隆起。高身鏟頜魚成魚體延長而近於紡錘 形，尾部側扁，體高而隆起，背鰭前方為 體之最高處。 頭小而略圓，頭頂部隆起， 腹部圓。
台灣溪流中游常見魚類有：
平鰭鰍科：台灣間爬岩鰍*、埔里中華爬岩鰍*、南台中華爬岩鰍*、台東間爬岩鰍*。
鮰科：台灣鮰*、南投鮰。 鮠科：脂鮠*、短臀鮠*。
鰕虎科：明潭吻鰕虎*、小鯔鰕虎、極樂吻鰕虎、蘭嶼吻鰕虎*、恆春吻鰕虎*、台灣吻鰕虎、南台吻鰕虎、日本禿頭鯊。
鯉科：台灣石(魚賓)、平頜鱲、粗首鱲*、菊池氏細鯽*、高身鯽魚&、鯁魚(鯪魚)*、草魚(水庫埤塘)、翹嘴鮊、鯉魚、陳氏鰍鮀*、中間鰍鮀、白鱎(䱗魚)、何氏細鬚䰾、高身小鰾鮈、短吻小鰾鮈、台灣副細鯽*、羅漢魚、台灣細鯿、何氏棘魞*、飯島氏頜鬚鮈*、唇䱻、紅鰭鮊&。
台灣河流下游及河口常見魚類有：(包含近海進入河口的魚)
鯔科：大鱗鯔青魚(烏鰡)。
鰍科：中華花鰍、泥狗魚。
塘虱魚科：泰國塘虱魚&、土虱。
鯉科：高體鰟鮍、團頭魴(武昌魚)&、革條副鱊、大眼華鯿、台灣細鯿*、鯽魚。
鯉科鰱屬：大眼海鰱、 黑鰱(鱅)*、白鰱
虱目魚科：虱目魚。
脂鯉科：脂鯉&。
鯰科：花鯰。
胡瓜魚科：香魚。
鮨科：點帶石斑。
狗母魚科：狗母梭。
花鱂科：大肚魚&、孔雀魚&。
慈鯛科：莫三比克口孵魚(南洋鯽)、尼羅河口孵魚、吉利慈鯛(吳郭魚&)。
海鯰科：斑海鯰。 甲鯰科：琵琶鼠&。 合鰓魚科：黃鱔。
絲足鱸科：蓋斑鬥魚、三星攀鱸&。
鱧科：七星鱧&、小盾鱧(魚虎)&、線鱧(泰國鱧) &。
塘鱧科：中國塘鱧、褐塘鱧、短塘鱧、筍殼魚。
鰕虎科：大彈塗魚、彈塗魚。
湯鯉科：湯鯉、大口湯鯉、銀湯鯉。
鯡科：環球海鰶、信德小沙丁魚。
鯻科：花身雞魚、條紋雞魚。
棘臀魚科：大口鱸。
鰏科：短吻鰏、短棘鰏。
笛鯛目：銀紋笛鯛、黑斑笛鯛。
鯛科：黑鯛、黃鰭鯛。
沙鮻科：沙鮻。
雙邊魚科：小雙邊魚、蘭嶼玻璃魚
常見台灣迴游魚類有：
鰻鱺目鰻鱺科：鱸鰻、白鰻、短鰭鰻、美洲鰻&。
鰕虎科：大吻蝦虎魚、日本禿頭鯊。
溪鱧科：溪鱧。
河流下游及河口間短距離洄游：湯鯉科、塘鱧科、鯔科魚類。
常見台灣近海魚類有：銀鱗鯧、六帶鰺、金錢魚、黑鯧魚、白鯧魚、赤魟、海鰻、多寶魚、石斑魚、比目魚、梭魚、馬頭魚、海鯽魚、藍點馬鮫、沙丁魚、午仔魚、嘉鱲魚、黑毛魚、鮸魚、凹鼻魨、沙鮻、金梭魚、白帶魚、鯊魚、鮪魚、鬼頭刀。
圖13.1 台灣河流上游魚類
圖13.2 台灣河流中游魚類
圖13.3 台灣河流下游及河口魚類
圖13.4 台灣洄游魚類
13.3 魚類的生理構造
淡水魚類的骨骼是由硬骨構成的，在頭骨的兩邊有四至七片鰓，其中最前面的一片演化成了下劾骨。魚的脊椎骨是與頭骨連在一起的，在胸部有肋骨與脊椎相連，在背部，尾部和腹部有從脊椎伸出的長的刺。硬骨魚在肌肉內常有硬化的脛所構成的魚刺。魚使用鰭來控制它的方位和運動。大多數魚的鰭內有骨質的刺來加強。胸鰭和腹鰭是成對的，並通過肩和髖的肌肉相連。背、尾和肛鰭與脊椎相連。有些魚背和尾之間的鰭內沒有刺，但可以硬化成角質以得以加強。魚運動時主要依靠身體的擺動和尾鰭。
淡水魚類有兩層皮膚，表層的皮膚內含有能夠分泌粘液的腺，內層有許多連接組織，鱗和色素細胞也在這一層裡。外層的粘液幫助魚減輕其游泳時的阻力。
魚用鰓呼吸，大多數魚類使用氣體交換鰓上的兩側咽，由絲的線狀結構組成。兩側各有一個鰓蓋開口。這個開口是隱藏稱為保護骨蓋下面。很多種魚可以在水中長時間生存。有些兩棲魚類，如彈塗魚、鰻等，能離水生活一段時間，或住在停滯貧氧的水體。許多這樣的魚可以通過多種機制呼吸空氣，鰻魚的皮膚可能直接吸收氧氣，許多鯰魚讓空氣通過腸道來呼吸。居住在季節環境變化大的淺水區魚類需要直接呼吸空氣，因為該環境中水的氧氣濃度可能會季節性下降。僅僅依靠溶解氧的魚類會很快窒息而死，能直接呼吸空氣的魚類生存時間可以更長。魚具有封閉的血液循環系統。大多數魚類的心臟位於鰓附近，血液通過主動脈流到鰓進行充氧。有頜骨的淡水魚類可以咬吃多種食物，包括植物和其他生物。魚類通過口器攝取食物，並在食道中分解。當食物通過消化道時，肝臟和胰腺等器官會添加酶和各種化學物質。腸道完成了消化和營養吸收的過程。
與許多水生動物一樣，大多數魚將其含氮廢物作為氨釋放。一些廢物通過鰓擴散。血液廢物由腎臟過濾後排放。淡水魚中：它們傾向於滲透吸收水。他們的腎臟會排泄稀尿。有些魚類的腎臟經過特殊改裝，功能各不相同，可以在淡水與海水之間遷徙，特別是河口廣鹽性魚類。
與其他脊椎動物相比，魚類的大腦比例很小，通常是類似體型鳥類或哺乳動物的大腦質量十五分之一。大多數魚具有高度發達的感覺器官。幾乎所有的日光魚類的色覺都至少與人類相同。許多魚類還具有化學感受器，這些感受器會產生異常的味覺和嗅覺。儘管它們有耳，但許多魚可能聽不到很好的聲音。大多數魚類具有形成側線系統的敏感受體，該受體能夠檢測出輕微的電流和振動，並感應附近魚類和獵物的運動。
視覺是大多數魚類的重要感覺系統。魚眼鏡頭與鳥類和哺乳動物等陸地 脊椎動物的眼鏡頭相似，但晶狀體更為球形。它們的視網膜通常具有視桿和視錐(用於暗視和明視覺)，並且大多數物種具有色覺。有些魚可以看到紫外線，有些魚可以看到偏振光。
聽力是大多數魚類的重要感覺系統。在水下，聽力閾值和定位聲源的能力會降低，在這種情況下，聲速比在空中快。水下聽力是通過骨傳導實現的，聲音的定位似乎取決於通過骨傳導檢測到的振幅差異。因此，水生動物很多具有在水下有效的更加專業的聽力設備。
魚可以通過其側線和耳石感覺到聲音，它們的功能就像助聽器。鯉魚的聽力很發達，具有韋伯氏器官，這是三個專門的椎骨過程，可將游泳膀胱中的振動傳遞到內耳。
大多數魚通過在脊椎兩側交替收縮成對的肌肉而運動。這些收縮形成S形曲線，其向下移動到身體。當每條曲線到達後鰭時，向後的力將施加到水上，並與鰭一起使魚向前移動。魚鰭的功能就像飛機的襟翼一樣。鰭也增加了尾巴的表面積，提高了速度。魚的流線型身體減少了與水的摩擦。由於身體組織比水更稠密，魚必須彌補差異，否則魚會下沉。許多淡水硬骨魚的內部器官稱為游泳膀胱(魚膘)，可通過操縱氣體來調節其浮力。
魚的生殖器官包括睾丸和卵巢。在大多數物種中，性腺是大小相似的成對器官，可以部分融合或完全融合。也可能有許多次要器官會增加生殖適應性。魚的生殖器官位於身體側部腸的上方。大多數魚是體外交配，雄魚和雌魚同時將它們的生殖細胞排泄到水中。
新孵出的卵生魚被稱為幼體體(larvae)。它們通常形態不佳，帶有一個大的卵黃囊(供給初期營養)，與成魚外觀差異很大。卵生魚的幼體期相對較短(通常只有幾週)，幼體體迅速生長並改變其外觀和結構(稱為變態的過程)成為幼體魚。在這種過渡過程中，幼體體必須從卵黃囊轉變為以浮游動物為食，這通常取決於浮游動物密度不足，使許多幼體餓死。
魚類的身體結構通常取決於水的物理特性，水是魚賴以生存的媒介。水比空氣密度大得多，其溶解的氧相對較少，並且吸收的光比空氣多。魚的身體分為頭部，軀乾和尾部，儘管三者之間的劃分並不總是在外部可見。形成淡水魚類內部支撐結構的骨骼是由硬骨製成的。主要的骨骼元素是椎骨柱，由關節椎骨組成重量輕但堅固。肋骨附著在脊柱上，沒有四肢或四肢帶。魚的主要外部特徵是鰭，由射線的骨刺或軟刺組成，除尾鰭外，魚鰭與脊柱沒有直接聯繫。它們由構成軀幹主要部分的肌肉支撐。眼睛適合在水下看，只有局部視野。有一個內耳但沒有外耳或中耳。低頻振動是由沿著魚兩邊長度的感官器官的側線系統檢測到的，該系統對附近的運動和水壓的變化做出響應。
淡水硬骨魚的譜系顯示出更多的衍生解剖特徵，它們具有骨架，一般都是橫向扁平，具有5對由保護鰓蓋口，和一個在口或口鼻部的尖端附近。真皮覆蓋著鱗片。淡水硬骨魚有一個游泳膘囊，可以幫助它們在水體中保持恆定的深度，但不會使泄殖腔保持恆定。他們大多產卵大量蛋黃的小卵，然後撒入水體中。
魚眼類似於鳥類和哺乳動物等陸地脊椎動物，但具有更球形的透鏡，如同照相機中魚眼鏡頭的效果，可以觀察很寬的超廣角。
位於鰓蓋下的魚鰓是呼吸器官，用於從水中提取氧氣和排泄二氧化碳。它們通常不可見，但在某些物種中可見，用於允許魚從空氣提取氧。耙是指在鰓弓上的手指狀突起，在過濾器進料器中起到保持過濾獵物的作用。
魚的表皮完全由活細胞組成，在表層細胞中只有極少量的角蛋白。它通常是可滲透的。硬骨魚的真皮通常只含有很少的四足動物結締組織。相反，在大多數魚類中，它已被堅固的保護性骨鱗片所代替。許多魚的外部被鱗片覆蓋，這是魚外皮系統的一部分。鱗片起源於中胚層(皮膚)，其結構可能與牙齒相似。一些魚類被覆蓋鱗甲代替。也有些魚類的皮膚上沒有外殼。大多數的魚類被粘液(粘液)保護層覆蓋。
魚身體上的側線是用於檢測周圍水中的運動和振動的感覺器官。例如，魚類可以利用其側線系統追蹤逃逸獵物產生的渦流。在大多數物種中，它由沿著魚兩邊延伸的一排受體組成。許多魚類外觀有部分閃耀的螢光，螢光體是發光的器官，在某些魚類上以發光點的形式出現。
在淡水硬骨魚中，大多數鰭可能有刺或輻鰭線。輻鰭通常是柔軟的、有彈性的、分段的。輻鰭線的這種分割是將它們與刺區別開的主要區別。魚刺有多種用途。在鯰魚中，它們被用作防禦的一種形式。許多鯰魚有能力將其脊椎向外鎖定。甚至使用外骨刺將自己固定在岩石縫隙中，以防止它們被拉出。
像其他動物一樣，魚也患有疾病和寄生蟲。為了預防疾病，他們有多種防禦措施。非特異性防禦包括皮膚和鱗屑，以及表皮分泌的粘液層，該粘液層可以捕獲並抑制微生物的生長。如果病原體破壞了這些防禦能力，魚會產生發炎症反應，從而增加血液流向感染區域並輸送白細胞，從而破壞病原體。
圖13.5 魚類器官功能(一)
圖13.6 魚類器官功能(二)
圖13.7 魚類器官功能(三)
圖13.8 魚類器官功能(四)
13.4 環境條件對魚種分佈的影響
魚類的地理分佈受到限制。對於某些物種來說，這種分佈可能覆蓋了廣闊的地理區域。有些環境限制分佈的原因是魚類進化所處的物理環境的異質性。因為物理屏障會阻止種群間的基因流動，從而允許物種形成。
屏障可能一個不可逾越的瀑布，或是一個延伸的水體，其性質是物種無法生理上容忍的。比如海水對初級淡水魚是一種有效的屏障，因為它們在高鹽度下無法滲透調節。淡水魚類的高比例可能反映了進化和生物地理學對物種豐富度的影響。淡水棲息地比連續的海洋更加破碎。在淡水中，種群更可能與來自其他種群的基因流隔離開來，因此更有可能形成物種。也可能有陸地和海上的屏障阻止擴散。
各種非生物特性對魚類分佈的重要性隨水生環境的性質而變化。對於魚類來說，主要的特徵通常是溫度、氧氣、鹽度和水的運動。其他特性，如pH值、有毒物質的存在和壓力在特定環境中可能很重要。
魚類只能在溫度等非生物特性的一定範圍內生存。在這個範圍之外，魚會死亡或難以繁殖。溫度、氧氣和鹽度都可能是致命因素。有些物種能容忍廣泛的同一性。
耐受區描述了一個個體的範圍，在這個範圍內存活是可能的，但是活躍的攝食、生長和繁殖只能在較窄的範圍內進行。一個物種能夠通過自然招募成功地維持自身的這些特性的範圍部分地定義了該物種的基本生態位)。一個物種的總體地理分佈將在很大程度上反映其基本生態位；然而，與其他生物的相互作用可能會將該物種限制在比其基本生態位預測範圍更小的範圍內。一個物種可能暫時佔據一個區域，但由於該區域所處的環境條件的範圍，該物種無法成功地在那裡完成其生命史。個體的耐受性可能在個體發育過程中發生變化。這種現象在淡水和海水之間遷徙的物種中表現得最為顯著。
氧氣供給呼吸組織的速率將限制有氧代謝的速率。魚的體型越大，對氧氣的需求也就越大。然而，呼吸速率與體重並非成正比，而是異速生長關係。這意味著單位品質的耗氧量隨著魚的體重增加而降低。
雖然氧在水中相對不溶解，但魚的鰓和相關的呼吸適應在水飽和時允許有效的功能。當氧水準下降到飽和以下時，就會達到一個臨界氧濃度，低於這個濃度，代謝率和其他過程就會受到供氧的限制。最終，氧氣濃度達到了魚無法無限期存活的水準，即致命水準。由於氧的溶解度隨著溫度的升高而降低，而魚類的代謝率則隨著溫度的升高而增加，所以在溫水中達到致死水準的危險通常比在冷水中高，除非有屏障阻止氧氣從空氣中擴散到寒冷的地方水。水中氧濃度低通常是由腐爛的有機物造成的。這些環境還容易產生硫化氫和甲烷等有毒氣體。
對低氧濃度的耐受性各不相同(Varley, 1967)。像鱒魚、鮭魚、鏟頜魚這樣的低氧物種需要每升含氧量超過10mg氧氣的富氧水。泛氧物種，包括鯉魚和藤條鯉，能耐受低至0.5mg/L的氧氣濃度。
大多數魚類一生都生活在鹽度變化不大的水中。然而，有些人生活在諸如河口之類的環境中，那裡的鹽度變化很快。其他物種在遷移過程中，在鹽度差異很大的水域之間移動。這些物種必須滿足由鹽度變化引起的滲透和離子調節的額外能量成本。偶爾，鹽度的突然變化可能會導致災難性的死亡，例如，當海水衝破屏障，沖入淡水瀉湖時。有些魚遵循鹽度梯度，在鹽度不同的水域之間找到它們的適應區。
流動的水有很高的動能量。這對任何試圖佔據棲息地的生物來說都是個問題，比如河流和有大量湍流和深潭。體型是一個重要的特徵，因為它決定了水流經過魚的方式，無論魚是在水流中停留還是在移動。身體形態也會影響特徵，如有效操縱、快速加速、長距離巡游或靠近底層居住的能力。使魚具有高度機動性的體型與持續巡游或快速加速和轉向不相容。因此，魚的形狀往往強烈地反映了它典型的生活方式。
河流級序是描述魚類分佈的一種有用的河流結構分類方法。一級序溪流是指沒有支流的河流。兩個一級序溪流的匯合產生一個二級序溪流，兩個二級序溪流匯合產生三級序溪流，依此類推。一個方便的定性區分是河流的上游地區(低級序溪流)、陡急溪流河和下游地區(高級序河流)低緩大河。這些地區在河道的物理特性上各不相同，因此魚類的非生物特性也相對重要。
陡急溪流魚類適應
河流的上游通常具有相對陡峭的坡度和高而多變的水流量。淺水湍急的淡水含氧量很高，但體積小意味著它們的溫度會隨著氣溫的變化而變化。河流中游的典型形態是湍瀨和深潭的交替出現。湍瀨是淺水區，水流速度高，水流湍急。在深水潭裡，水比較深，所以水流比較慢，也不那麼湍急。水流的流速決定了所攜帶的泥沙量。較細的沉積物往往沉積在深水潭中，而較粗的顆粒則形成分汊河床。由於陡急溪流在高降雨量或快速融雪時會經歷高流速水流，河床通常不穩定，泥沙被洪水沖到下游。這樣的河流通常會切割出深深的溝壑，所以即使水位上升很快，水流還是被控制在山谷內，只有一個有限的區域被洪水淹沒。
在這種環境中的魚類必須適應多變的水流及其後果，以及經常出現的每日和季節性溫度波動。在旱季，溪流可能會分裂成一系列深水潭，限制了魚類的生存空間。
有些魚的體形使它們能夠在快速移動的水中站穩。某些魚類演化出吸盤可以固定在急流的石頭上，某些魚類利用石頭、倒流木障礙物後面的靜水，進入溪流中收集食物。其他物種在形態上適應了生活在溪床上，利用水流速度較低的石頭之間的縫隙和洞。某些溪流魚類(禿頭鯊、吻鰕虎)改良的成對鰭或嘴被用作吸盤。脊椎也可以起到錨的作用。底棲魚類(鯰魚、比目魚等)通常是流線型的，背部略微隆起，腹側表面平坦，促使魚類保持水體中定位。這些身體特徵可能非常有效。當測試幾種物種在水流中保持其位置的能力時，表現最好的是一種生活在河底的鯰魚。它不是通過游泳來抵抗水流，而是通過吸盤附著在底部，甚至身體上的骨刺固定在岩石洞隙裡。體型和其他形態特徵的差異將使物種能夠在河流中佔據深度和水流特徵不同的微型棲息地。這種微棲息地隔離可能對減少具有相似飲食的物種之間的種間競爭很重要。
低緩大河魚類適應
在這一地區，河流的坡度變緩，河道形態變得更加複雜。除主河道的侵蝕和沉積模式外，河流還形成了回水、牛軛湖、堤壩和濕地。因此，在洪泛區，當河流被限制在其主河道內時，存在很少或沒有水流的水生棲息地。在這些離開主河道的池塘，有根的水生植物可以生長。洪水發生時，陸地植被區也被淹沒。與物理多樣性的增加相關的是，河流魚類的多樣性增加，因此，總體而言，在一個排水系統內，物種數量和河流級序之間存在正相關
隨著坡度的減小，主河道中的流速也會變緩，在主河道水體中度過全部或大部分生命周期的物種具有流線型的體型，適合近距離連續游泳。相比之下，通常與植被相關的靜水區域被身體形態更好地適應短距離機動或快速加速的物種所佔據。機動性通過一個較短的、相對較深的體型和擴大的成對鰭來增強。快速加速的能力是由一個相對較長的物體所增強的，它的長度大致相等。大棘銀鱸、大眼梭子魚潛伏在植被中，直到能夠向路過的獵物猛撲過去。鯰魚，身體背側扁平，適合生活在底部或靠近底部；魚類如鰻魚，身體細長，可以在植被、石塊中滑行。
儘管較大的水量往往比陡急溪流河更能緩衝溫度波動，在淺水回水區和漫灘湖泊中，水溫與氣溫的關係比幹渠更為密切，因此變化更大。生活在這些洪泛平原棲息地的中高緯度物種通常比生活在陡急溪流的物種更廣熱。鯉魚、七星鱧和蟑螂等可以在超過30°C的溫度下生存，而馬口魚、鏟頷魚和其他更具陡急溪流特徵的狹窄物種通常僅限於水溫遠低於25°C(Elliott, 1981)。
流速越慢，植被發育越茂盛，懸浮物濃度高，就越有可能出現低氧(缺氧)情況。在低緯度的河流系統中，由於高溫下氧的溶解度降低，這種危險增加。氧濃度可能成為決定魚類分佈的一個重要因素。在靜水和漫灘湖泊中，植被在白天會因光合作用而增加氧氣濃度，但在夜間，活植物的呼吸作用和有機碎屑分解產生的需氧量會將氧氣消耗到遠遠低於2ppm的水準。在水溫約為30°C的低緯度地區，溫度的微小差異與水密度的相對較大差異有關。這導致穩定的分層或分層，溫暖的水漂浮在較冷的水上。在沒有風或感潮混合水域的情況下，即使在淺水區也會出現這種分層現象。較深的水域則有完全無氧(缺氧)的趨勢。如果發生水體的後續快速混合，許多魚類可能會因地表水的突然去氧而死亡，這種影響因分解過程中的有毒副產品(如硫化氫)的存在而加劇。
在大多數地區，低緩河流的魚類比陡急溪流魚類更能忍受低氧條件。事實上，有些鯉魚可以通過無氧呼吸在缺氧期間存活下來，因此能夠耐受極低水準的氧氣。
最常見的適應是行為上的。當水中的氧氣濃度下降時，魚開始接近水面，並利用水的表層，水通過擴散保持良好的氧氣化。這種行為被稱為水面呼吸。一系列的形態特徵，如上翹的嘴，肉質的嘴唇和扁平的頭部，增強了利用這一表面水層的能力。在其他物種中，適應性使魚能夠從大氣中獲得氧氣。魚浮出水面，吞下空氣，然後用於呼吸。改為呼吸表面的結構允許進行空中呼吸，包括皮膚(例如，短喙下鰓)、口和咽的襯裡、魚鰾和消化道的一部分。對大多數物種來說，空氣呼吸是對正常水生呼吸的補充，但在少數物種中，空氣呼吸是強制性的
河水化學成分取決於集水區的地質和土壤，但魚類的分佈只受極端水質的影響。
隨著河流等級的增加，物種豐富度的增加通常是通過在集合中增加物種來實現的。然而，隨著梯度的減小，通常伴隨著平均水溫的升高和平均氧濃度的降低，魚類群落中的優勢種發生了變化。對於台灣河流，從源頭水域到河口的動物區系依次發現鏟頷魚(苦花)、平頜鱲(溪哥)、鲃鯉魚類和鯛魚(吳郭魚、烏魚)分佔在不同的梯度河段。這代表了一系列魚類的序列，部分初級淡水魚喜歡涼爽、含氧良好的小型、快速流動的低階河流，而不是喜歡寬闊、緩慢、含沙量高的河流。
河口魚類適應
河口對任何生物來說都是一個重大挑戰，因為河口經歷了廣泛的非生物條件。首先是河口下游鹽度的變化，從河流本身的淡水條件到河口外緣的全海水的影響。此外，河口任何一點的鹽度都會隨著潮汐和河流淡水排放方式的變化而變化。與海水相比，淡水的密度較低，這意味著河流傾向於流經一個鹹水較多的舌部，舌部的位置隨著潮汐和季節的變化而變化。漏斗形的河口增加了潮汐變化的幅度，也可以使風形成漏斗，從而產生複雜的洋流。這種水流運動，再加上河流帶來的泥沙，常常使河口變得渾濁，底質不斷變化，不穩定。
潮汐運動和季節性洪水在河口兩側形成定期淹沒的池塘和瀉湖。即使在很短的時間內，這些深水潭的鹽度、氧氣濃度和溫度也會發生很大的變化。
在熱帶地區，紅樹林沼澤遍佈許多河口以及有遮蔽的海岸線，這些水域具有一些河口特徵，包括可變鹽度和高含沙量(Lowe McConnell, 1987)。在這些沼澤地中，非生物條件可能非常惡劣，溫度在20-40°C之間，鹽度從0到46 ppt(ng/L 奈克/升)，氧氣濃度高度可變。
也許並不令人驚訝，考慮到嚴酷的非生物條件，在河口環境中度過一生的物種數量很少。然而，河口和紅樹林許多物種幼雛逐漸成熟。河口也是這些物種的走道，它們定期在淡水和海洋之間穿梭，這是它們正常生活史的一部分。
儘管一些海洋物種可能會通過鹽水舌深入河口，但在完全河口條件下發現的唯一物種是能夠在所經歷的各種鹽度範圍內生存的廣鹽性物種。海水和淡水物種除外。典型的河口物種有鰕虎科、吳郭魚、鯉魚、線鱧。其中許多是小型(>100mm)魚類，它們的全部或部分生活在邊緣池塘和瀉湖中。利用河口作為育雛區的群體包括鯛魚(笛鯛科)和鯔魚(鯔魚科)。
最常見的河口魚類是底棲魚類。鰕虎生活在熱帶和溫帶的河口。河口淺水區的其他常見魚類，鯉魚，有游泳囊，比鰕虎更流線型。它們的胸鰭也很發達，它們可以用來悠閒地游泳和小心地操縱，只是在短距離內用身體和尾巴進行運動。
鰕虎魚說明了一些河口物種的極端廣鹽性。那些佔據河口池水塘、瀉湖和紅樹林沼澤的物種也會隨著有機物的腐爛而經歷低濃度的氧氣。在淡水中有些物種，如彈塗魚，依靠水面呼吸。
在河口生態系中，物種依其食性與獲得營養的方式，可分為初級生產者、食草動物、食碎屑動物及食肉動物。形成食物網。初級生產者如各種浮游植物及肉眼可見的大型植物等，成為該環境中食草動物(即初級消費者)，包括環節動物(沙蠶)、軟體動物(螺、貝類)、節肢動物(蝦、蟹)及脊椎動物(魚類、鳥類)等食物來源。多數的溫帶、亞熱帶及熱帶地區的河口，是以碎屑為其食物網的基礎。碎屑的來源包括此區的大型水生植物與紅樹林、濱水植物，以及自近海或河川中下游的輸入。而食碎屑動物包含沙蠶、沙蟹科、蜆、蛤等。這些食碎屑動物或濾食動物又成為其捕食者(魚、鳥、大型螃蟹等的食物。還有蝦、蟹幼蚤體以浮游生物為食，亦是此區食物網的一部份。
在食物網上層，魚類多樣性的變化隨著食物網基層組合而改變。依食性種類可分為食草、食底泥、食底棲動物、食浮游生物及食魚等不同的魚種。各類魚種之相對比例與數量，也因各河口區之條件不同而迥異。當水體混濁且淺時(如淡水河)，浮游生物生產量大，於是吸引以攝食浮游生物為主的魚類。當水體清澈而養份少(如大甲溪、和平溪)，浮游生物生產量稀少，將只吸引食底泥和食底棲動物的物種；此食物網是以碎屑食物做為基礎。由於沙質海岸與河口區潮位變化大、潮差明顯，不利於大型魚類停留，水域中缺少大型次級以上消費者。主要的次級消費卻是來自水鳥、候鳥，代表著此區的物質與能量的輸出。
13.5 魚類的棲息與遷徙
水的運動範圍從山間溪流的急流、海浪對岩石海岸的撞擊、潮汐在平緩擱淺的海灘上的漲落，到緩慢移動的洋流。除非魚表現出積極的行為機制來阻止它，否則它們會隨著水流一起移動。卵、幼體和幼魚要麼缺乏主動運動的機制，要麼這些機制發育得太差，無法防止被動移位。在生命史的早期階段，魚類的活動很大程度上取決於卵在何時何地下蛋。隨著運動能力的成熟，魚變得能夠抵抗水的運動，並且能夠對它們將生活的棲息地做出積極的選擇。
體型是影響游泳能力的另一個主要因素。大小影響魚的操作和可以達到的絕對速度。
硬骨魚幼體在其水動力環境中經歷了粘性阻力。它的作用是，運動一旦停止，幼魚就不能向前滑行而不主動游泳。對於較大的魚，粘性阻力變得不那麼重要，而壓力阻力占主導地位。在持續游泳中，游泳肌肉所需的能量由有氧呼吸提供。魚不會積累氧債，只會慢慢疲勞。捕食者在短距離的水域中追逐獵物，以快速遊動，以顯示其快速遊動的能力。維持游泳的能力對於大面積覓食、在緩慢但穩定的水流面前保持姿勢或長距離遷徙非常重要。為了比較不同大小或種類的魚，通常使用臨界游泳速度。當魚在深水潭中逐漸增加游泳速度時，達到疲勞前的最大速度。
魚有游泳能力，但是魚群也會有領域感，個體的全部或部分生命都生活在固定棲息地。魚類為了保護領域，必須宣示領土主權。地形行為使居住者能夠自行扣押該地區的資源。為了保持對其他魚類的排斥而必須支付的任何成本必須抵消這種隔離的好處。該區域可能只防禦同種異體，或在某些例子中同時對抗異種魚類。被隔離的資源可能是食物、庇護所、產卵地或這些的組合。魚一生中的一部分時間，可能與群聚點中的其他魚類一起度過。魚群的形成取決於魚在社會上的相互反應，而不僅僅是魚聚集在對它們有吸引力的地點，而不是因為與其他魚類的存在無關的地方。“群聚shoaling”和“巡游schooling”是魚類的重要行為，但是淡水魚類因棲地空間與食物資源的關係表現的較少。
群聚或群游中的魚被捕食者攻擊的風險可能降低。它還可以提高個體找到食物的機會，食物分散在整個棲息地中。在魚群中生存的一個可能的代價是，當發現食物時，對食物的競爭會加劇，因為魚群的成員身份確保了個體被其他個體包圍。
在某些物種中，群聚可能覆蓋廣闊的區域，而在其他物種中，群聚可能佔據一個家的範圍。單個群聚對空間的利用是一個迫切需要更多資訊的主題。
許多群聚魚種也會遷徙。遷移的一個有用的定義是那些導致兩個更為獨立的棲息地之間交替的、有規律的週期性發生並涉及大量種群的遷移。這種魚在一生中在棲息地之間來來往往，或者一次，或者每年週期性地。為了進行洄游，魚類必須失去它們可能既有棲息地的環境資源。根據種群豐度來衡量，許多遷徙物種都非常成功，這表明遷徙行為的好處大於壞處。
通常，遷徙會在適合覓食的棲息地和適合繁殖的棲息地之間捕食。它們還可能包括從棲息地進出的活動，這些棲息地形成了對環境不利的庇護所，這些環境可能是由於不利的非生物條件，也可能是因為捕食者或病原體的存在使它們變得危險。描述魚類遷徙的術語現在已經發展出來了。
河豚類的遷徙完全局限於淡水。它們可能涉及河流系統內的遷移或河流和湖泊之間的遷移。兩側洄游物種在海洋和淡水系統之間遷移。分為三類。溯河產卵的物種遷移到淡水中產卵，但他們的一部分生命都在海裡覓食。降海產卵物種遷徙到海裡產卵，但在其生命週期的一部分時間裡都在淡水中覓食與成長。兩棲類物種在海洋和淡水之間遷移，但遷移與繁殖沒有直接聯繫。溯河物種的特點是它們具有在具有不同岩杜滲透性和離子性質的水域之間移動的生理能力。
圖13.9 餵養，產卵和育雛棲息地之間遷移的基本模式。
圖13.10（a）溯河洄游（b）降海洄游。
13.6 河流中的魚類遷徙
河流對魚類活動有兩個重要特徵。首先，水流基本上是單向的，因此上游運動，甚至僅僅停留在水流中，都取決於魚的主動遊動。相反，下游運動可以被動地進行，魚隨波逐流。在許多河流中，高瀑布、急流、人為堰壩是上游運動的障礙。在屏障上方的延伸段，只有當魚類表現出將下游巢穴減少到允許種群持續存在的水準的行為特徵時，種群才會持續存在。河岸和河底提供了一個相對穩定的地形，如有必要，魚類可以利用它來確定特定地點的方位。
在北半球溫帶河流的上游，鮭魚提供了與自然環境相關的洄游；東亞的鰻魚往返於馬里亞納深海區與沿海溪流中游之間的洄游；鯔科魚類、鰕虎魚類、蝦蟹往返於沿海溪流中游與河口海岸區的洄游。許多鮭科動物在水流湍急的小河中的礫石中產卵。部分溯河產卵的鮭魚中，幼魚從礫石中出來後很快就會下潛到海裡，但是多數洄游物種中，在遷徙之前，溪流停留的時間較長。這些魚佔據了一個位置，使它們能夠接近漂流而過的獵物，同時也為它們提供了躲避水流的庇護所。棲地位點被視為領土。然而，一條魚會從一個棲地位點移到另一個棲地位點，當它離開一個棲地位點時，它會被另一條魚重新佔據。有些棲地位點比其他棲地位點更受歡迎。
河流保證了從上游進入漂移有機物的持續供應。以生活在基質中的無脊椎動物為食的物種，或是以高度活動的獵物為食的物種，在覓食時往往分佈廣泛。魚可以作為個體生活在群聚或覓食中。即使是鮭魚或鰻魚，當它們變大並在其飲食中包括許多小魚。
河流中的遷徙通常與繁殖、水位季節變化導致的覓食地開放或向越冬地區遷移有關。
河流的上游通常以含氧良好的水和足以防止泥沙沉降的水流為特徵。食肉漁類對魚卵和幼體的密度也可能較低。這一綜合因素可能是許多河流物種向上游遷徙產卵的原因。在較大的河流系統中，這些上游遷徙覆蓋了很長的距離。
在低緩河流中，季節性的高水位漫過河岸，淹沒了周圍的土地，為淡水魚類開闢了廣闊的覓食區，比如高屏溪中下游豐枯水期的河幅寬度差距10至20倍。雨季初期，許多魚從支流進入主流，在主河道產卵。產卵後，洪水淹漫高灘地，剛孵化的幼魚有了豐富的食物。雨季結束時，幼魚已經足夠大，會向上游或支流移動，然後散佈到丘陵樹林溪流段覓食。在枯水期，它們間歇性地向上游移動。隨著魚的年齡增長，它們在河流系統中向上游遊得越來越遠，而下游的魚卵和仔魚補充了它們的數量，這些卵和幼體被沖到了主河道的下游。稍大的幼魚搬進泥沼、洪泛平原湖泊和被洪水淹沒的河畔植被中，小而脆弱的體型迅速成長。
大多數河流系統的一個特點是幼魚會轉移到有遮蔽的淺水區，在那裡它們不太可能被沖走，並且有良好的食物供應，也避免大型魚類捕食，台灣馬口魚的幼魚就很容易在溪流淺水區被發現。在河流系統的管理中，提供這些區域對於維持許多魚類種群至關重要。
一些大陸河流的魚類可能在河流和湖泊水庫之間遷徙。在一條溪流中生活一年或數年，維持部分區域，並以漂流為食。然而，這些魚會向下(或向上)遷移到河系中的一個湖泊水庫。在湖泊水庫中，它們的活動範圍要寬廣得多，因為它們不能再依賴不斷補充的漂流物。在性成熟後，它們會重新登上一條溪流產卵，通常會選擇它們孵化和度過生命最初幾年的溪流。類似的上游產卵遷移也出現在一些熱帶湖棲物種中，包括鯉魚洄游。
13.7 魚類河海洄游
洄游分佈
所有或部分魚類定期在淡水和海水之間移動的物種包括一些最著名的洄游物種，包括北太平洋的太平洋鮭魚、歐洲和美洲鰻魚以及希爾薩(印度和東南亞的hilsa ilishaj)。溯河魚類包括原始但特殊的無顎七鰓鰻，這種生活方式在原始硬骨目、棍狀目、鰻形目和鮭形目中得到了很好的體現。它在進化更高級的硬骨魚中更為零星地出現(McDowall, 1988)。
溯河產卵魚類和水下產卵魚類的分佈存在地理格局，在熱帶和亞熱帶有一個峰值。這反映了鰻魚(鰻鱺科)和鯔魚(鯔科)的地理分佈。鰻魚基本上是來自溫暖水域的一個群體，也碰巧是降海產卵魚類。在高緯度地區，海洋的生產力高於淡水。從淡水遷移到海洋的魚會遷移到更肥沃的覓食地(鮭魚的索餌洄游)，因此與呆在淡水中的魚相比，它們的生長速度會有所增加。在低緯度地區，淡水往往比海洋更有生產力，而遷移到更肥沃的覓食地會把魚從海水中帶到淡水中(鰻魚、鯔魚、蝦蟹的索餌洄游)。與生產力梯度有關的任何遷移都可能受到一些因素的影響。
圖13.11 溯河洄游物種相對於緯度的頻率。 向北緯度顯示為正值，向南緯度顯示為負值。 重點：（1）鮭魚；（2）其他鮭科魚類；（3）鯡形目；（4）其他魚類。 McDowell1988。
圖13.12 降海洄游物種相對於緯度的頻率。 關鍵：（1）鰻鱺屬;（2）鯔科; （3）其他魚類。 McDowell1988。
返鄉機制
有很好的證據表明，許多遷徙物種為了產卵而返回或靠近出生地。在一些洄游鮭魚種群中，只有不到5%的回游魚類未能返回其出生的溪流(Quinn, 1984)。在北海的鯡魚和鰈魚中，來自不同種群的成魚在不同程度上可能會在覓食地上進行不同程度的混合，但它們的產卵遷移會將它們帶回出生產卵地。魚是如何回到它們產卵的繁殖地或回到它們的家鄉池塘的？
環境提供了許多線索，理論上，這些線索可以被洄游繁殖或索餌的魚類使用。這些因素包括水流、溫度和鹽度的梯度、嗅覺刺激、白天太陽或夜晚恒星的位置、白天天空中偏振光的模式以及地球磁場的變化。這種過多的潛在線索提出了兩個問題：哪些線索可以使用，哪些線索在遷移過程中使用？
在長距離長時間的河海之間遷徙之後，這些魚是如何找到它們的家鄉河口的，還有很多不確定性。一種可能性是，這些魚表現出輕微的方向性運動，將它們帶到適當的海岸線(有偏差的隨機搜索)，然後在海岸線上搜索攜帶適當家的水氣味的淡水羽流。另一個極端是這種魚有可能擁有發達的導航能力，這使它們能夠直接和高精度地回家。導航能力假設是基於對太陽的位置和位置變化的探測，以及在陰天的情況下，地球磁場。其他研究表明，即使是在它們遷徙的海洋階段，鮭魚也在使用嗅覺信號，與鹽度和溫度的電流和梯度有關。
13.8 攝食與生長
魚類必須從食物中獲得營養素，大量的營養素是蛋白質、脂類和少量的碳水化合物。這些宏量營養素提供基本的組成部分，即蛋白質中的氨基酸、脂類中的脂肪酸和碳水化合物中的醣類，它們被用來修復身體組織的損傷，並合成新的肌肉。大量營養物質也是在呼吸過程中被氧化的燃料，產生能量。這種能量被用來維持一個功能正常的身體，游泳和合成身體生長或生殖產品(卵子或精子)形式的新組織。微量營養素是必需的維生素和礦物質，少量的，是有效新陳代謝所必需的。微量營養素和微量營養素的需求可能從許多方面得到滿足。在淡水硬骨魚中，廣泛的潛在食物反映在廣泛的飲食和餵養方法上。
潛在的食物種類在很大程度上反映了自然環境。一個物種的活動範圍取決於它探測、獲取和加工食物的能力。綠色植物光合作用的初級生產是魚類最終食用的幾乎所有宏觀營養素和有機微量營養素的最初來源。然而，與陸生環境相比，食草性脊椎動物常常是動物群的顯著組成部分，而食草性魚類通常不是水生食物網的主要組成部分。其中一個原因在於水生環境的基本特性。水環境中的大部分初級生產是由單細胞藻類產生的，它們通過水的浮力維持在水體的發光區域。這些藻類很小，需要一個細網或篩檢程式來收集它們，才能在顯微鏡中看見。通常情況下，魚類通過食肉水生昆蟲、軟體動物、甲殼動物等間接利用這些藻類資源。水生植物或樹葉投入，僅限於河流邊緣的淺水區。受水流或感潮影響也會阻止植物大量生產。因此食藻或食草魚類只佔少數比例，即使剷頜魚、草魚也是雜食，不排斥各種肉食。
雖然有些魚類可以以腐爛的物質和有機碎屑為食，但大多數魚類直接或間接地以碎屑無脊椎動物為食。腐爛物質的原始來源可能在群落內部，其來源是本地的，也可能是起源於另一個群落但已進入水生群落的物質。這種物質被稱為外來物。因此，腐爛的水生植物形成了一個本地的碎屑來源，但是從河邊或集水區樹葉掉入河流就是一種外來的營養和能量來源，任何陸地節肢動物或其他落入水中的動物也是外來的營養和能量來源。
在討論魚類的攝食生態學時，一個有用的術語是guild行會-同功群。在同一棲息地中以相同營養水準為食，以相似的方式開發同一類資源的魚類，構成了一個行會(同功群)。
陡急溪流的魚類攝食
在溪流上游，經常發生的急流阻礙了有根植物的生長和大量浮游植物的生長。或者河谷茂密樹冠遮蔽陽光阻礙附著藻類生長。初級生產是由藻類和苔蘚產生的，這些苔蘚包裹著河床中的石頭和岩石。隨著分汊池結構的發展，溪流魚類食性的多樣性才能增加。
某些上游河段魚類，以落入溪流中的陸生無脊椎動物為食，而不是溪流中產生的食物。隨著河流級序的增加，魚類的數量也在增加。第一批是以水生昆蟲為食的，鯝魚(鏟頜魚)以生長在溪流中的藻類為食。它們都是本地的食物來源。隨著溪流的進一步擴張，增加了攝食同功群。以水生食藻動物為食者、以水生食肉動物為食者、以螺貝類為食者、以蝦蟹類為食者等。
鯝魚(鏟頜魚)的口部就是主要適應於鏟刮石頭上的藻類，也吃昆蟲與軟體動物。
臺灣馬口魚主要以水生昆蟲及植物碎片為食，個性相當貪食，甚至躍出水面捕食飛行昆蟲。
粗首鱲幼魚為雜食性而成魚變為吃昆蟲、蝦和小魚的肉食者。
平頜鱲、初級淡水魚。喜好棲息於河川的中游附近，生性活潑，具群集特性。雜食性，或追足掉下水中的昆食、或捕食水生昆蟲、或刮食石頭上之藻類等為食。
爬岩鰍棲息於溪流中、上游水流湍急之高溶氧區域。為底棲性魚類，平時平貼於石頭上，屬雜食性，以岩石附生藻類和水生昆蟲為食。鰕虎魚的食性很雜，但是肉食為主，比它小的魚、蝦、蟹、昆蟲、蠕蟲都是鰕虎魚的食物，也攝食附著藻類。
禿頭鯊(日本瓢鰭鰕虎) 腹鰭有吸盤，嘴也有吸盤，什麼都吸，屬雜食性偏草食性，主要以附著藻類為食，也吃小蟲。
鮠科魚類(脂鮠、短臀鮠、台灣鮠)，喜歡棲息於河川中上游的水層底部棲息。白天躲於岩石縫隙中，大多於夜間或洪水期才出來覓食。肉食性，以水生昆蟲、小魚及小蝦等小型動物為食。
何氏棘䰾游泳能力強，主要棲息於河川中下層水域且水流湍急，底質為礫石的河段，幼魚常可在溪岸的淺水區發現。屬雜食性，以水生昆蟲、小魚及藻類為食。
小鰾鮈性喜棲息於淺瀨、深潭及潭頭的河床石礫上，群聚溯游而覓食。雜食性，以啃食附著藻類為主，另外也食有機碎屑及水生昆蟲。
鰍鮀喜棲息於溪水湍急且溶氧量高的溪流底層，對環境的忍受力較低，雜食性，主要以底棲小型無脊椎動物為食，或是啄食石礫而濾食藻類及有機碎屑為食。攝食時，將吻部鑽入沙中，以濾食其中的有機碎屑及其他小生物。
愈往下游，本地食物越來越重要，也表現在熱帶溪流的魚群中，雖然本土食物的貢獻增加了，但主要的能源供應來自外來植物材料。
上游一、級序河流樹冠遮蔭對溪流魚類的攝食生態有重要影響。遮蔽陽光，溪流中幾乎沒有初級生產力，主要的能量輸入是從陸地植被落葉、倒伏和陸地無脊椎動物的輸入。在這些溪流中，主要的食性同功群是雜食性動物，它們既可以吃動植物，也可以捕食陸生或水生無脊椎動物。
大多數溪流魚類的一個特點是它們能夠攝取許多不同種類的食物，因此它們能夠對食物供應的變化作出反應。這種靈活性可能在不同的河流環境中以不同的方式表現出來。如果溪流環境變動，落葉季節或茂密樹冠季節、低溫季節或高溫季節，某些魚類或其他物種的首選食物減少，更多的物種轉而攝入碎屑，溪流魚類在攝食方面的必須靈活改變或進行生理適應能力。
低緩河流的魚類攝食
低地平原的河灘地寬大，河廊棲息地多樣性反映在食性群落的多樣性上。當低緩河流氾濫時，被淹沒的地區提供了潛在的豐富的食物來源。淹死的陸生無脊椎動物成為食肉動物和雜食動物的食物，土壤中的營養物質可以支援浮游植物和相關的浮游動物的大量繁殖。當洪水淹沒的地區是森林時，樹木會再次收穫。許多魚類移到淹水的高灘地上，甚至以植物果實為食。許多魚類也將洪水季節當作育雛季節，調節遷徙與繁殖活動。而在旱季，當河流被限制在主河道內時，河寬縮小，魚類或者遷回上游或支流尋找食物，或者潛入河底淤泥中(鯰魚、黃鱔、泥鰍)，度過乾季或冬季，依賴於洪水期間釋放的脂肪儲備。
鯽魚食性是很雜的浮游生物，動物，浮游植物，苔癬，菌類，很愛吃小蝦、蚯蚓，幼螺。
鯉魚棲息於平緩多水生植物水域，游泳能力強，會在淡水河流內季節遷徙，進行生殖洄游與索餌洄游；幼魚與稚魚攝食浮游動物及少量的浮游植物，成魚以水生昆蟲、水生植物、底棲動物，如:螺、蜆、小蚌為食。
鯰魚、塘蝨魚，廣泛棲息於底緩河流、湖塘等泥質的水體中。常群集於岸邊暗處或洞穴中，能長期間離水，遷移能力強。為夜行的底層活動魚類，食性廣，不僅捕食小魚、蝦，也攝食腐敗的動植物碎屑。
翹嘴鮊，常棲息於低緩河流或水庫湖泊大水域，為兇猛肉食性魚類，魚幼苗期以浮游生物及水生昆蟲為主食，50公克以上主要吞食小魚小蝦，也吞食少量幼嫩植物；體型更大後主要捕食其他魚類。
䱗條，初級淡水魚。是低海拔常見之魚類，喜歡群聚棲息於溪流、湖泊及水庫等水體之上層。主要攝食藻類，也食高等植物碎屑、甲殼類及水生昆蟲等。繁殖力及適應性強，能容忍較污濁之水域。
烏鰡、吳郭魚、草魚的咽部特別強，能夠吃福壽螺、田螺或蜆。鯰魚為肉食性魚類，捕食對象多為小型魚類，如鯽魚、鰕虎魚、鯉魚、泥鰍等，也吃蝦蟹類和水生昆蟲。 以吞食為主，牙齒的作用主要是防止食物逃脫。
鰻鱺科貪食、好動、晝伏夜出、趨光性強、喜流水、好暖。鰻鱺是一種廣鹽性、肉食性魚類。自然界鰻苗主要攝食浮游甲殼類，長大後進入淡水河流中上游深水區洞穴，以魚類、蝦蟹等為食，亦偶而會爬行至陸地上攝食小型陸生動物，如蛙類、蝸牛、蚯蚓等，也吃植物的碎屑。
泥鰍、花鰍棲息於低緩水域或濕地，屬雜食性，以蠕蟲、小型甲殼動物、昆蟲等為食，容忍溫度在 2 與 30℃之間, 而且在水中氧氣不足時，能直接呼吸水面上的空氣。
鰟鮍、革條副鱊棲息於低海拔平緩處之池沼或溝渠。雜食性，主要以附著性藻類、浮游動物及水生昆蟲等為食。依賴水中的淡水蚌類作為互利寄主。大肚魚、青鱂魚，大多成群地在水體的表層活動。偏好在低海拔溪河的緩流區，對於環境污染的耐受力強，可以在污染的水域或低溶氧的環境下生存。雜食偏肉食性，以浮游動物、如孑孓等之水棲昆蟲及碎屑為食。
高體四鬚鲃棲息於低海拔的溪河緩流區的河段，活躍於水體的中下層，可適應於濁度頗高的水域。雜食性，以水生昆蟲、底藻、甲殼類及小魚等為食。
線鱧(泰國鱧、七星鱧) ，外來種，多是外來種，又稱魚虎，最大可達80cm的巨型魚種，主要攝食蜻蜓幼蟲、蟑螂、甲蟲、螯蝦、蛙類、鯉魚以及其他淡水魚，尤其喜歡在水面捕食。生活水域通常不會深過10公尺。 具特別的呼吸器，叫做上鰓器，可以直接浮上水面呼吸空氣，因此無論在溪流中或是混濁的沼澤缺氧水域都可生活。
琵琶鼠(下口鯰)，外來種，以藻類、水生植物、沉積腐敗的有機物等為食。
在一些熱帶河流的魚類區系生物量中，碎屑魚類占很大比例。它們利用森林被淹地面和河灘上水窪池塘中的碎屑。淹水區、河彎區和回水區是河流魚類幼魚的重要育嬰區。滯流的水域使豐富的動植物群得以發展，微生物適合作為剛孵化幼體和幼魚的食物。
鯔魚以採食浮遊動物、硅藻和有機碎屑等為主，喜食軟餌厭食硬餌(食性類似鱅魚)，常吃底泥、苔蘚、浮遊動物、小魚小蝦、水生軟體動物及腐爛的水蛭、沙蠶，具有食腐習性。在鯔魚的食譜中只有水蛭和沙蠶是既柔軟又易掛鈎，是鯔魚最喜愛的食物。
河口魚類的攝食生態
對於那些能夠忍受苛刻的身體條件的動物來說，河口提供了高產的飼養場。一種主要的能源是進入河口的碎屑，或是從河口植物腐爛而來的碎屑，如紅樹林、河口濕地植物、水草、河畔林等。魚類主要以底棲動物或無脊椎動物為食。橈足類、枝角類、蝦蟹幼體，都可能成為河口魚苗的食物組成。隨著魚類的生長，它們攝食大型動物群的比例增加，如多毛類蠕蟲、大型甲殼類動物、軟體動物和小魚。
碎屑(及其相關的動植物群)也被河口和沿海魚類所利用。物種利用這種豐富但品質差的食物來源的有效性各不相同。包括鯔魚、鰻魚苗以碎屑為食。吳郭魚為雜食性，以藻類及腐敗物為主食，但缺乏此等餌料時亦可捕食微細生物、水中昆蟲、小魚及小甲殼類等。
花身雞魚、條紋雞魚，游泳能力強，它們屬於肉食性魚類，以小型底棲無脊椎動物為主要食物。體長小於2公分的花身雞魚苗以浮游性撓足類生物和端足類生物為食，隨著體型的增長，當它們真正變為底棲魚類之後，改以蝦、蟹、軟體動物及其他小魚苗為食。
湯鯉科大都生活於海水域或汽水域，但有些種類亦會出現於淡水域。屬夜行性之掠食者，主要以浮游性的甲殼類為食。成魚喜棲於淺的內灣性海域、河口區及淡水域，幼魚及較小之成魚則常見於潮池中或成群在岸邊洄游。
口孵魚(吳郭魚)，廣鹽性，且對溶氧較少之水有極強之適應性，棲息河口至河川下游，繁殖能力強，生長快速，雜食性，以浮游生物、藻類、水生植物碎屑等為食。
塘鱧科，棲息於河口、淡水、近海沿岸、潟湖、礁沙混合區、白天較少游動。屬肉食性，以小型底棲無脊椎動物為食。
環球海鰶，鯡科魚類，有時會進入河口域、半淡鹼水之河川下游、內灣或潟湖區內產卵。群游性。以浮游生物為食。
雙邊魚科河口近海域小型至中小型魚類，通常活動於汽水域，或進入感潮帶河段，有些為純淡水魚類。群游性。肉食性魚類，以水生昆蟲及小型魚介貝類為食。
鑽嘴魚科(銀鱸科)，常進入河口區及河川下游。主要棲息於近海砂地水域或沿岸內灣之砂泥底水域，但亦常出現於河口或淺海砂質地產卵或覓食。屬肉食性魚類，以底棲性之小型無脊椎動物為食，或吞食砂泥後，再以鰓耙濾食其中之生物為食。
斑海鯰屬於亞熱帶沿岸之底棲性魚類，棲息於海域、潟湖、河口、河川感潮帶等鹹水或半淡鹹水域，對不同鹽度的水域適應良好。成魚主要出沒於海域，幼魚較常進入河口與紅樹林水域。屬於肉食性，主要以小型魚蝦等水生動物為食。
鱗鮻魚，主要棲息於沿岸砂泥底質地形的海域，而河口區或紅樹林等半淡鹹水海域亦常見其蹤跡，亦常侵入河川下游。以底泥中有機碎屑或水層中的浮游生物為食，群棲性，常成群洄游。
吉利慈鯛，次級淡水魚，屬廣鹽性魚類，對環境適應力強，污濁的水質也能存活。雜食性，以水棲昆蟲、有機碎屑及藻類為主。繁殖力強，棲息於較緩流的水域，於沙泥處挖洞形巢產卵；有護巢行為。
覓食
魚類的飲食受到了大量的研究。科學家經常切開一條魚，看看它最近吃了什麼。可能的結論是：魚類是機會主義者，逮到甚麼吃甚麼。魚類是個體，有學習能力。它們的環境和食物供應持續變動，魚必須不挑剔的吃才能生存。
人們可能問，魚吃什麼來解決攝食角色的問題？第二，它們如何進食？在溪流和河流中，絕大多數魚類在生命週期的某個時刻吃無脊椎動物，許多魚類一生中的大部分營養來自無脊椎動物。有些魚一旦長到足夠大就變成食肉動物。一些成年魚類以植物為食，但由於植物食物的季節性供應(也很難消化)，純吃素的魚類並不常見。
有些魚類嘴形如吸盤專門撿拾石頭表面的藻類，也包含底棲動物。魚類如何進食增加了另一層複雜性，特別是對食肉動物而言。一些來自底棲生物，一些來自水體，一些來自河底軟泥有機物。尤其在熱帶河流中河底軟泥有機物更為豐富，濾食魚類更多，並且以鯉魚所代表。大型河流可以提供足夠的浮游生物與小型魚類來支援大型魚類，島嶼型的中小溪流，除了特別能吃的線鱧(魚虎)很難支持大魚的食物供應，很少棲息大體型魚種。
魚的嘴、牙齒和內臟有著各種各樣的適應能力，以適應它們的飲食習慣。嘴是腹側的底部攝食器，如吸盤的嘴，或向下傾斜如鏟的頜，用來吸攝底棲生物。上翹的嘴用來撿食水面漂浮的食物；向前(中間的)用來水體中巡弋，在水體中捕食的；闊嘴的魚(吳郭魚等)。大多棲息在河流下游，大量濾食浮游生物。魚可以有靈活的嘴唇，有助於分類獵物，並可以創造強大的吸力，並擴大後側的咽部。魚的牙齒出現在三個地方：上下顎、舌頭和口腔頂部以及咽部。咽齒通常用於研磨和壓碎，特別是在底部攝食器中，尤其是在淡水魚中，允許它們壓碎大型軟體動物的硬殼。鰓弓也有助於捕獲食物，因為它們能夠專門從水中分離浮游生物。
腸道提供了另一個適應飲食結構的機會。食草動物，如鏟頜魚和泥鰍、草魚，都有長長的、盤繞的腸子來提供植物碎屑長時間的消化。食肉魚類通常有短而簡單的腸道，可能完全沒有胃。大型食肉魚類，如小口鱸魚，有一個可膨脹的胃來處理大型獵物。主要濾食浮游生物的魚類，因為食物更容意消化與吸收，腸道比食肉魚類更短。
儘管有這麼多的特殊性，魚還是很機會主義的，幾乎所有的規則都有例外。有食人魚的河流雖然不常見，但是專門的食肉的食人魚，當水果豐富時，食人魚也會吃水果。
躲避捕食者
吃、生存、長大、繁殖：這就是生命的意義。捕食者比比皆是；只有較大物種中較大的個體才有可能免於這種風險，甚至這些個體都不能免除人類捕食的威脅。魚有各種各樣的防禦機制，其中隱藏可能是第一位的。佔據縫隙、洞穴和隱蔽處，夜間活動，是很好的防禦措施。尖刺和毒藥為防禦增加了另一個維度，群體行動和游泳速度也是如此。視覺、檢測環境湍流的側線，對受傷魚釋放的恐懼氣味的化學訊息，以及在某些情況下，發出聲音，都是規避風險的手段。魚類似乎對潛伏的掠食者的意圖有著驚人的能力，也許從來沒有忽視過它的存在，但有時似乎表現出更高的意識。許多魚類會根據對捕食風險的評估來改變它們對棲息地的利用。它們的獵物可能更容易在開闊的水域捕食，但如果附近有食物，最好在雜草叢生或石堆縫隙的地方進食，而不是在開闊水域冒險成為獵物。
棲息地
從微小的源頭河流到有海灣和回水的大河灘地河流；穿越高和低梯度地形；流過基岩、礫石或砂質基底；蜿蜒、層疊梯瀑、湍瀨和深潭之間變化；河流棲息地極為多樣。魚類佔據了所有種類的棲息地，而且大多數都是在有限的一個子集中發現的。因此，對棲地的描述成為生物學家的一項重要活動。通常，我們將微棲地(比如細顆粒的礫石上流動的淺而快的水)與百米長的快速水流分開來，後者包括湍瀨、水潭塘、溪流、底切河岸、倒伏樹木堵塞等等。事實上，我們可以繼續將空間尺度擴大到一個山谷段，長度可能為10公里，河流本身，可能是一條較大河流的支流，最終是河流系統。這種對棲息地的分層視圖有許多原因是有用的。很明顯，隨著空間尺度的擴大，棲息地的多樣性也在增加，這可能解釋了為什麼魚類物種的數量會隨著河流的大小而增加。它提醒我們，不同的棲地出現在不同的河段，因此保護生物多樣性需要保護許多不同類型的棲地。
水利工程師開發了許多快速、有用的方法來描述棲息地品質。美國環保署EPA推薦的評分系統，您可以很容易地將其應用於您所在地區的河流。要瞭解這種方法的更多資訊，它需要根據您所在地區的條件進行調整。一般來說，河底有大量淤泥並嵌入底質的溪流是無脊椎動物和魚類產卵的不良棲息地，因為水和必要的氧氣不會自由循環。穩定的河岸是個好選擇，被侵蝕的河岸則不是。在溪流內以懸垂的植被和木材的形式覆蓋也是好的。水流和深度的多樣性將支持比統一棲息地更多的魚類物種。
當然，棲息地是很重要的，因為所有的魚類都表現出一定程度的棲息地特化，有些是非常特殊的。我們只能重點介紹處理各種魚類科的一些例子。魚類和任何器官生物一樣，都會表現出一系列的適應能力，這些適應能力“結合”在一起，形成整個生物體。陡急溪流的棲息地是快速、多石、乾淨的河床。退化的魚鰾和強化的胸鰭，使爬岩鰍、禿頭鯊適應了固定在那裡的位置。它們的大嘴和大眼睛幫助它們捕捉生活在水面上的昆蟲。在這個棲息地，守巢也許不是生活的必需品，但它確實提供了許多平坦的岩石，正好適合雌性的卵附著在下面。
13.9 生活史和種群動態
魚類在體型、棲息地和攝食方式上的多樣性與其生活史模式的多樣性相匹配。與攝食有關的身體形態和特徵的適應意義被解釋為與魚生活的地方和它如何生存有關。但是魚所表現的生活史模式與它所生活的環境有什麼關係呢？什麼樣的模式最有可能確保這種魚留下一些後代，從而在下一代遺傳上得到代表？
生活在相似棲息地中的成魚可能有不同的生活史特徵。一個明顯的對比是河流硬骨魚類到外海或河口產卵(鰻魚、鯔魚)，產卵量很多，卵粒很小(直徑1-3mm)，隨波漂流，這些卵在外部受精，存活率遠小於河流水域產卵的魚類。到河流水體中產卵的魚類(鮭魚、鯝魚)，產卵量較少，卵粒更大顆，黏附在樹枝、岩礁上，存活率大的多。魚能產生的卵的總體積將受到產卵前體腔中容納卵(或正在發育的胚胎)的空間的限制。卵的總體積由成熟卵的數量(繁殖力)和單個卵的體積決定。在魚類中，體型較大的魚一般不會產生較大的卵，因此繁殖力隨著體型的增大而增加。
較大的卵產生較大的孵化後幼體。嘴的大小、遊動能力和感覺能力都會隨著體型的增大而增加，因此孵化出較大尺寸的魚能夠探測到並利用更大範圍的獵物，而且不易受到捕食。為了使進化有利於更大的卵，通過大尺寸孵化而獲得的生存收益必須補償後代數量的減少。
生態學理論預測，在其他條件相同的情況下，在早期達到性成熟是增加後代遺傳代表性的有效途徑。然而，它的代價是在較小的尺寸下成熟，因此繁殖力較低，而且可能比大尺寸成熟的魚面臨更廣泛的捕食者的風險。
魚的生命史始於受精卵，充分供給以發育成自由游動的幼魚。幼蟲發育成幼體，一般與成魚相似，但形狀、顏色、食性可能不同，然後發育成成魚，魚的一生都在生長。
魚類的繁殖是多樣的，有時是奇怪的，而且肯定是分類學的。魚類養殖的分類可分為五類。把卵撒在水底、植物或水體上的魚被稱為產卵後不提供照顧或保護的魚。許多吸盤魚類和小魚把卵撒在河底；鯉科魚把卵撒在大河的水體裡。通常通過掩埋卵來隱藏卵的魚，但不提供進一步的照顧。鮭魚和魚類在礫石層中建造育嬰巢。吳郭魚表現出更高水準的親魚照顧，保護他們的卵，有時在孵化後保護他們的幼仔。雄性保護魚巢，趕走捕食者並清除殘骸。底棲魚類，很好地保護雌性在岩石下面沉積的卵。提供另一種先進的親魚參與形式。有些魚類很容易被觀察到築巢，有助於減少卵子捕食。巢也是求愛的基礎使其成為動物行為類最喜歡的科目。包括口孵嘴的大小。
兩性變易
台灣養殖石斑魚研究也發現溫度與性別轉變之關係。石斑魚的體型大小是決定雄性繁殖能力的重要因素，大型的雄魚由於擁有比較大的地盤和比較發達的生殖腺，要比小型的雄魚有更多的機會參與交配。 因此，演化使得每一個個體在體型小、不適合扮演雄魚角色時，都先成為雌魚，以避開繁殖上的劣勢。
目前有許多可能的解釋，例如在自然情況下魚類會性轉變是由於族群因素，也就是在同族群中，本來雄魚與雌魚的比例構成一個穩定的雄雌關係，若是把雄的移走，那其中一尾雌魚的會在數天內發育成為雄魚的。另外一種可能是，由於性轉變可以獲得更有利的生殖策略，因此年紀較小時(較小體型)是雄魚的，年紀較大且體型較大時變為雌魚的，例如黑鯛，因為較大體型的雌魚產卵個數較多，有利於族群存活。也有一種可能是避免「近親交配」，黑鯛長到第三年才變成雌魚，交配對象是出生一、二年不同親代產生的成魚，因此可避免近親交配的現象。這種種可能的原因促使雌雄同體的魚類，在長期演化的過程中，慢慢發展出具有特色的性轉變生殖策略。
陡急溪流的魚類繁殖
在低級序溪流中，高流速和可變流速對產卵魚類既有利又不利。其優點包括高含氧量的水，其流速可防止沉積物在卵上堆積。一個主要的缺點是，魚卵和幼魚有被沖到下游並被殺死的風險。
在北美和歐亞大陸的冷水、旱地溪流中，最常見的物種是鮭科、和一些鯉魚。它們把卵埋在礫石巢穴裡，那裡有很好的水流。產卵時，巢穴周圍的區域會受到有力的保護，尤其是雄魚。許多雄性鮭魚會發展出第二性特徵，即長有尖牙的鉤狀下顎，用來與其他雄性進行搏鬥。雌性在洞裡產卵，卵附著在牆上。雄魚給卵通風，保護卵不受入侵者的侵襲。溪流上游的鯉魚，把卵撒在岩石和石頭之間的縫隙裡，但不守衛這個地點。鯛科的魚類會在生殖期間尋找適當的產卵點，公魚誘導母魚進到產房產. 卵後完成受精，親魚會共同保護小魚直到小魚獨立。
香魚在其分布區內有三個不同的生態觀，即終生生活於湖泊的「陸封型」；在湖中生活，但在繁殖期上溯到河川2至3公里處產卵的「溯河型」；以及棲息於河川上游，每年秋冬之際，順流到河川下游產卵，產卵後親魚死亡，孵化後仔魚會順游至河口，以浮游生物為食，之後就生活在河川的中上游的「降海型」。成長後的香魚會以附著在岩石上的藻類為食。具強烈的領域性，強壯的成魚會佔領一塊長滿藻類的大礫石，不准其他香魚入侵。
溪流產卵鮭魚的卵是河流硬骨魚產生的最大的卵之一，其繁殖力也相應較低，根據體型大小有幾百到幾千個。溫帶海洋和淡水物種的卵直徑比較表明，淡水物種(包括河流和湖泊物種)的卵往往較大)。從大卵孵化出來的較大的幼體在應對水流和開發更大的獵物方面可能有優勢。在自來水中，浮游植物和小型浮游動物通常以低密度存在。
長期生活在這些低階河流中的魚類通常體型較小。它們通常是連環產卵的。大型魚類通過向上游遷徙來開發產卵的棲息地。它們是全部的產卵者，而且在許多情況下都是類似的。
低緩河流的魚類繁殖
對許多低緩河流河的魚類來說，它們的繁殖生物學適應了洪水的周期或氣溫升高溶雪週期。產卵通常發生在枯水和洪峰之間的某個時間段，只有在洪水下降時才很少發生。這個時間安排確保幼仔孵化到一個覓食棲息地面積不斷擴大的環境中。
整批同時期產卵在低緩河流魚類中很常見，這可能是因為洪水週期中有一段時間對卵的發育和幼魚的生長最為有利。連環產卵魚類也出現了。它們通常是壽命短的小魚。大多數的低緩河流魚類都是多次繁殖。
產卵地點可以在主河道或淹沒的植被中，大型魚類從上游或支流遷徙到主河道產卵，然後移到被洪水淹沒的高灘地淹水區覓食。幼魚被沖到下游的靜水和氾濫的水窪地或草澤中。
無脊椎動物或脊椎動物捕食卵和幼體的風險在低緩河流魚類中比在陡急溪流中更高。在所有的產卵者中，短時間內產生大量的卵，提供更高的存活數量，洪水高懸浮固體，混濁的水質，也提供掩護。其他的魚守護著它們的卵。在像脂鯉這樣的物種中，被保護的卵附著在植物上。鰟鮍通過一個長的管狀產卵器將卵沉積在淡水貽貝的外套腔中。吳郭魚會在感潮的淺水泥地上用尾鰭掃出一個個淺圓盤，然後產卵魚其中，減少被其他魚類捕食的機率。馬口魚幼魚會聚棲在河邊淺水灘，躲避大魚的捕食。
口孵非鯽屬，如尼羅吳郭魚由雄親魚負責挖洞築巢與護巢，在僅數小時的求偶行為後，雌親魚產卵於巢中，並由雌親魚吸起卵粒含於口中，利用口腔內不停地吸水活動使魚卵在口腔內滾動孵化。之後，雌親魚離巢，並孵育魚苗直到具游泳能力為止，初具游泳能力的魚苗在剛開始的一段時間內，仍會游至雌親魚口中尋求庇護。 吉利慈鯛、吳郭魚屬多次產卵型，因此卵巢的發育並不同步，通常產卵後很快地在8∼10天就會有60∼70% 的卵進入卵黃生成期。在產卵頻度方面，自然環境下口孵吳郭魚產卵間隔約30∼50天。而吉利吳郭魚只要6∼7天就可以再產卵。由於口孵魚的照顧能力較高，所以其孕卵數相對較低，每次產卵約數百到數千個，卵徑較大。吳郭魚的產卵模式除了受到內在因子如賀爾蒙等的調控外，也會受到溫度、光週期、營養、水質和社會行為等許多外在因子的影響，而繁殖力和卵的大小則與雌魚的年齡和體型相關，同時也受到食物的質與量影響。
大多數高灘地育雛魚類避免了產卵時由於水位下降而暴露在外的危險。然而，一些鯉科魚類可以在定期乾涸的池塘中維持種群數量。這些短壽命的“一年生”小魚產卵，當池塘排空時，它們可以在底泥或植被中存活。卵進入滯育期，在此期間卵發育受阻。當池塘重新注滿時，進一步的開發就得到了刺激。
河口魚類的繁殖模式
雖然河口被許多海洋魚種用作育雛區，但只有少數物種在那裡繁殖。這種物種往往是體型小，連續產卵和某種形式的親魚照顧是常見的。例如鰕虎科魚類。少數物種利用潮汐週期來降低其卵被水生食肉動物捕食的風險。這些物種在漲潮時產卵，將卵產在潮濕的植被或潮濕的沙灘上。隨著潮水退去，這些卵雖然仍處於潮濕的環境中，但還是冒了出來。孵化發生在隨後的高潮時，此時卵再次浸入水中。由於潮汐週期和月相的關係，這些物種通常有一個潮汐產卵週期。
不確定的種群-再利用關係和優勢年類現象突出了理解影響產卵和性成熟開始之間生存的過程的重要性。生命最初幾個月發生的事情通常是至關重要的。捕食和食物充足，以及溫度和水運動的影響，可能是影響幼魚存活的主要因素。這些因素可能以複雜的方式相互作用。在高食物水準下，魚可以生長得更快，因此不易被捕食。如果有足夠的食物，生長速度往往會隨著溫度的升高而增加，但是更高的溫度也會導致更高的新陳代謝率和更饑餓的捕食者。
在某些物種中，卵黃被吸收後開始獨立攝食可能是一個關鍵時期。如果幼魚適宜食物的濃度不足，魚就會變弱，變得更容易被捕食或挨餓。當仔魚開始攝食的時間與生產適合幼魚和幼魚的食物時，攝食、生長和存活都會很好。這將使那群魚得到很好的數量增加。如果幼體在食物稀少的時候開始進食，那麼從該群體中增加的數量將很低。
只有更好地理解食物水準、非生物因素和生物相互作用對生長、死亡和生殖的影響，才能理解氣候條件對種群動態的影響。
河流連續體與魚類
不同的魚類種類在河流的長度上出現，因此RCC與魚類有關。河流從源頭到河口時，會看見愈來愈大且愈多的魚，因此身體大小的總體範圍會增加。物種數量隨著河流規模的增加而增加，部分原因是增加了源頭中未發現的物種，部分原因是替換。棲息地的類型和數量以及可利用的食物沿河流連續統的變化，這對物種的存在有著深遠的影響。喜歡乾淨、快速的礫石流和以在這種棲息地豐富的水生昆蟲為食的魚類很可能不在低梯度、軟底的下游。相反，人們希望能找到以浮游生物為食的魚類，或是吸食有機物和偶爾的無脊椎動物的軟沉積物，或是以大型軟體動物為食的魚類。
魚類與生物評價
一個有經驗的河流生態學家可以“閱讀”一條河流的健康或虐待跡象，並作出相當公正的評估。魚類生物學家可以對魚類進行取樣，並告訴你塞納河的捕撈是否包括良好的多樣性，包括需要特殊棲息地和不耐污染的物種，或者採集的魚類是否只產生頑強的多面手。但是，如果這些評估是定量的、可重複的，並且在研究者之間是一致的，我們的信心就會增強。
生物完整性指數(IBI)是近20年前由現在華盛頓大學的Jim Karr開發的一種廣泛使用且有效的生物評估工具。生物學家從溪流中取樣，採用標準程式，規定努力程度、所覆蓋的距離(例如，平均溪流寬度的35倍，或三個重複的河灘流)，以及收集裝置。IBI有點像河流健康指數，它將10或12個指標組合成一個數位，然後與“差”、“好”或“優秀”等形容詞相關聯
13.10 台灣河流常見的魚類
淡水魚類依據其生活習性，可分為三種類別：
(1)初級性淡水魚，一生完全生活於河川中上游淡水域的魚種，譬如台灣鏟頷魚、高身鯝魚、台灣石賓、馬口魚、粗首鱲、羅漢魚等。
(2)次級性淡水魚，主要生活於河川中下游淡水域，但少數時候也到河口海水域逗留遊蕩的魚種，譬如吳郭魚、大肚魚、香魚、烏魚(鯔魚)。
(3)周緣性淡水魚，生活在河川中上游，但是也必須到海洋繁殖的魚種，譬如鱸鰻、白鰻、許多種鰕虎、日本禿頭鯊等。
台灣淡水魚類大約有160種，其中屬於初級性淡水魚約有60餘種，初級性淡水魚之中屬於台灣本土特有種約有 30 種。
淡水魚類棲地依據水質與水溫條件，大致可分為以下數種區段：
(1)高海拔低冷水區：高山V型谷地溪流，水溫15以下。源流河段落差大，溶氧極高，水中的營養鹽貧乏(貧腐水性)，很少魚類棲息，櫻花鉤吻鮭是個特例；鏟頜魚、纓口鰍、褐吻蝦虎只有在特定繁殖期才迴游進入高海拔水域。佔據台灣溪流海拔最高位置的應為台灣鏟頜魚、高身鏟頜魚(鯝魚)，偏好高山V型谷地湍瀨急流區，主要食藻，也雜食。新武呂溪霧鹿(海拔1200m)、阿里山達娜伊谷(海拔400m)、大甲溪龍安橋(海拔450m)、坪林北勢溪(海拔250m)都有發現。
(2)中海拔冷水區：海拔1500公尺至600公尺區間，水溫約為15至20度。該河段水質清澈，流速快，河床底質有許多中石塊生長附著性藻類；低棲昆蟲包含長鬚石蠶、水錢、網石蠶、蜉蝣、扁泥蟲等。鏟頜魚(鯝魚)、間爬岩鰍、台灣馬口魚、短吻鐮柄、米蝦等，都以藻類為主食。
河川的上游，大多湍急多岩石，多附著藻類，是許多魚類的主食，譬如鏟刮藻類的鯝魚(苦花)、馬口魚、纓口鰍喜愛乾淨水的魚種。上游的底棲昆蟲有石蠅、石蠶、水錢、網蚊、蜉蝣、扁泥蟲、水躉、錐螺、淡水蜑螺等，部份小蟲吃藻類或部份小蟲吃小蟲。
(3)中游丘陵河段：丘陵淺山區溪流，水溫約為20度或更高，水量大，水流略緩，深潭和急瀨交替出現。水中溶解有機物或浮游藻類較多(中腐水性)，水棲昆蟲及藻類食物源更豐富。魚的種類最多，而且很多魚類吃雜食，吃藻類、吃有機物碎屑、吃小蟲、吃小魚蝦。譬如平頜鱲、粗首鱲(溪哥)、爬岩鰍、台灣石賓(石斑魚)、粗首鱲(溪哥魚)、鰍鮀、爬岩鰍、禿頭鯊、溪鱧、吻鰕虎、何氏棘魞、台灣鮰、小鰾鮈、白鱎、沼蝦、澤蟹、拉式清溪蟹、川蜷螺、錐蜷螺等，都聚在中游丘陵河段的棲地。為了應付水流湍急的環境，爬岩鰍、禿頭鯊等魚種腹部有吸盤，能吸住淺瀨的岩石表面；部分魚種具備高強的游泳能力，或擅長躲藏在石塊的急流後方，或棲息躲避在深潭底，或聚集水濱緩流淺灘。
(4)下游河段：溪流離開丘陵地進入沖積扇平原後，河寬擴大，水流平緩，河川底質多為泥砂質或腐植質底泥，水質略為混濁，浮游水生物多，溶氧較低，蝦蟹螺貝類都多。本區河段魚類有濾食底泥的有機物者、浮游有機物者、專吃水生昆蟲者、專吃魚蝦螺貝者、多樣雜食者。譬如羅漢魚、鯉魚、鯽魚、鯛魚、大肚魚、鰱魚、鯰魚、田螺、椎實螺、福壽螺等。
(5)出海口河段：河川受感潮影響，水質可能比下游河段略佳，但是鹽度變化大，魚類必須對於鹽度的變化適應力強，因此又稱為廣鹽性魚類。出海口河段河底沉積的有機物、無脊椎動物很多，混濁度高，溶氧量低，附著性藻類及低棲昆蟲都很少。耐污染的許多魚類都有浮出水面直接空氣呼吸的本事，或特殊的「迷鰓」功能設計。
吳郭魚、烏仔魚(鲻魚)、豆仔魚、塘蝨魚、鱧魚、塘鱧、土鰍、花身雞魚、湯鯉、蓋斑鬥魚、鱸魚、泥鰍、彈塗魚、釘螺、囊螺、螺壁蜑螺都能適應這樣的出海口河段多泥質環境。
(6)迴游魚類：某些魚類的生活史中要跨越不同的上游與外海環境，譬如白鰻、鱸鰻、日本禿頭鯊、鰕虎科、鯔魚(烏魚)、香魚、陸蟹、毛蟹(絨螯蟹)、沼蝦、米蝦等繁殖期必須降到河口或外海產卵孵育，幼魚、幼蟹再上溯至山區，稱為「降海型迴游魚類」。部分鰕虎科魚類繁殖期必須上溯至山區產卵孵育，孵化後的魚苗則必須到海洋中留學幾個月才上溯至河川中上游繼續成長，稱為「降海型迴游魚類」。某些魚類也需要迴游，但是上溯、下降的河段範圍沒那麼大，譬如鯝魚成魚可以生活在20度的水溫環境，產卵孵育幼魚時必須上溯至水溫16度的上游河段(上溯海拔可能達500公尺)；粗首鱲、平頜鱲、台灣纓口鰍、爬岩鰍、台灣石(魚賓)、台灣馬口魚也是在河川中游與上游之間迴游。花身雞魚、大鱗鯔(豆仔魚)則在近海與河川下游之間迴游。
魚類可以作為河川水質污染程度指標，鯝魚必須生活在未受污染的水域(RPI約為1.0)；台灣纓口鰍、台灣石(魚賓) 出現在輕微污染的水域(RPI為1.0至1.5)；粗首鱲、平頜鱲、馬口魚、脂鮠、吻蝦虎大多出現在輕度污染的水域(RPI為1.5至3.0)；鯽魚、鯉魚、烏仔魚、花身雞魚、環球海鰶大多出現在中度污染的水域(RPI為3.0至6.0)；泥鰍、吳郭魚、泰國鱧、琵琶鼠大多出現在嚴重污染的水域(RPI大於6.0)。
台灣河川情勢調查常見魚類
陡急溪流魚類：台灣鏟頜魚、高身鏟頜魚(鯝魚)、台灣馬口魚(鬚鱲) 、台灣纓口鰍、台灣間爬岩鰍、埔里中華爬岩鰍、台東間爬鰍、平頜鱲、粗首鱲、臺灣石賓(石斑)、高身小鰾鮈、短吻鐮柄魚、台灣鮰、花鰍、何氏棘鲃(光倒刺魮)、白鱎(䱗)、紅鰭鮊、斑帶吻鰕虎、南台吻鰕虎、明潭吻鰕虎、大吻鰕虎、極樂吻鰕虎、日本禿頭鯊、曙首厚唇鯊、陳氏鰍鮀、中間鰍鮀、高體、脂鮠、短臀鮠、台灣鮠、溪鱧、短吻鐮柄(小鰾鮈)
低緩河流性魚類：菊池氏細鯽、高體四鬚鲃、鯉魚、鯽魚、白鱎、塘蝨魚、鯰魚、短吻鐮柄魚、三星攀鱸、棕塘鱧、唇骨魚(魚密)、短吻紅斑吻鰕虎、黃鱔、湯鯉、紅鰭鮊、翹嘴鮊、
低緩污染河流性魚類：吳郭魚(尼羅口孵魚)、青鏘魚、食蚊魚(大肚魚)、琵琶鼠、孔雀魚、七星鱧、小盾鱧(魚虎)、琵琶鼠、吉利慈鯛
河口及感潮河段：鯡科魚、鯔科魚(烏魚)、鑽嘴科魚、雙邊魚科、大眼海鰱、蓋斑鬥魚、大鱗鮻、白鮻、粗鱗鮻、虱目魚、斑海鯰、黑邊鰏、頸斑鰏、芝蕪綾鯷、星雞魚、花身鯻、花身雞魚、環球海鰶、浪人鰺、斷線雙邊魚、長鰭凡鯔、灰鰭鯛、大眼海鰱、塘蝨魚、彈塗魚、
周緣淡水魚：日本鰻(白鰻)、鱸鰻
大陸河川常見魚類
中國大陸珠江水系中，青魚、草魚、鰱魚、鳙魚、鱸魚、嘉魚、魽魚、鱖魚占據主要地位。中華鱘、鰣魚已經非常稀少。雀鱔、巴西龜、清道夫、食蚊魚等外來入侵物種威脅當地本土魚種。長江水系中，青魚、草魚、鰱魚、鳙魚、鱸魚、鱖魚較為常見，河魨出現魚感潮河段，鮰魚(長吻鮠)與刀魚為溯河產卵的洄遊性魚類。白鱘、江豚、鰣魚已經非常稀少。黃河水系中，因水壩、水電截流工程建設多，阻斷魚類洄游；水量減少，水位下降含砂量高，不利於魚類生態。主要是鯉、鰍兩科的魚類，養殖魚類佔水產品九成以上，黃河鯉魚、黃河刀魚、北方銅魚已經非常稀少。
大陸淡水湖泊魚類，青魚、草魚、鰱魚、鱅魚、鯉魚、鯽魚、赤眼鱒、白鰷、鯿魚、團頭魴、翹嘴鮊、鲶魚、鯔魚、鱤魚、淡水針魚、銀魚較為常見。
歐洲大陸河流從從源頭水域到沿海平原的淡水魚類分佈被描述為鱒魚區(鱒魚、鮈杜父魚、真鱥、花鰍)、茴鮭區(茴魚、鮭魚、雅羅歐鰱、大鼻軟口魚)、䰾鯉區(䰾魚、高體雅羅魚、赤稍魚)和歐鯿鯉區(歐鯿魚、丁鱖魚、河鱸魚、陸克鯉、湖擬鯉、白斑狗魚)。
歐陸陡急溪流魚群的代表性魚類：黑頭軟口鰷(鯉科，類似馬口魚)、牛頭魚(鯰科)、石泥鰍、褐鱒魚(鮭科)、大西洋鮭鮭。低緩河流魚群的代表性魚類：三脊棘背魚、鰻魚、鯉魚、丁鱥(鯉科)、魴魚(鯛科)、湖擬鯉、鱸魚、梭子魚(白斑狗魚)。河口魚類代表：普通鰕虎魚、比目魚-歐洲川鰈、鯔魚、大西洋鯡、牙鱈魚。
北美大陸河流，美西較常見到鮭魚、鱒魚；中央內陸河流較常見到鯉魚、吸盤魚、鯉亞口魚、北美狗魚與鯰魚；南部墨西哥灣河流較常見到鏘魚、孔雀魚、蝴蝶魚等大型原生魚；美東河流較常見到條紋鱸魚、黑鱸、大翻車魚和石鱸、太陽魚(北美慈鯛)、藍鲶魚、大嘴鱸魚。亞洲鱧魚是北美為為害最大的外來種。
南美大陸河流蘊含的五千餘種淡水魚種至少有整座大西洋的兩倍，甚至比歐洲和北美加起來還多。鯉魚、藤壺魚、湖擬鯉、巨骨舌魚、龍魚、象魚、紅腹鋸脂鯉(俗稱食人魚)、亞馬遜鯰魚、電鰻(類似脂鯉)、巴古魚、羅非魚、斑魚、貝斯魚、叉尾鱲、南美鴨嘴鲶、高翅海鲶、公牛白眼鮫、黑龍魚、鴨嘴魚(鯰科)、黃金河虎魚、加拉巴魯魚、金目麗魚、巨暴魚、孔雀鱸、大眼利齒脂鯉、牙魚、異鱗石首魚、肺魚等都是常見魚種。